Qua hơn 40 năm hình thành và phát triển, Trường Thuỷ sản đã không ngừng phấn đấu và phát triển lớn mạnh. Trường hiện nay có đội ngũ cán bộ giảng viên mạnh hàng đầu, với 98 cán bộ, trong đó có 55 cán bộ giảng dạy. Về học hàm, học vị, Trường có 8 Giáo sư và 25 Phó Giáo sư, 20 Tiến sĩ và 32 Thạc sĩ (trong đó 20 đang học tiến sĩ).

Về tổ chức chuyên môn, Trường có 6 Khoa (Sinh học và Môi trường Thủy sản, Bệnh học Thủy sản, Công nghệ Nuôi trồng Thủy sản, Khoa học và Công nghệ Biển, Quản lý và Kinh tế Thuỷ sản, Khoa học và Công nghệ Chế biến Thủy sản), 1 Trung tâm và Văn phòng Trường. Cơ sở vật chất của Trường ngày càng được nâng cấp, đầy đủ và hiện đại, nhất là từ dự án nâng cấp trường Đại học Cần Thơ (dự án ODA - Nhật Bản) với hệ thống phòng học, phòng làm việc, phòng thí nghiệm, trại thực nghiệm và các trung tâm, trạm nghiên cứu phát triển thủy sản.

Trường hiện đào tạo 5 ngành và chuyên ngành bậc đại học, gồm Nuôi trồng thủy sản, Nuôi trồng thủy sản - Chương trình tiên tiến giảng dạy hoàn toàn bằng Tiếng Anh, Bệnh học thủy sản, Chế biến thủy sản và Quản lý thủy sản, với tổng số 1500 - 1700 sinh viên. Đối với bậc Sau đại học, Trường đang đào tạo 5 ngành cao học gồm Nuôi trồng thủy sản, Nuôi trồng thủy sản giảng dạy bằng tiếng Anh – Chương trình quốc tế, Quản lý thủy sản, Bệnh học thủy sản, Biến đổi khí hậu và quản lý tổng hợp thủy sản ven biển và 2 ngành bậc Tiến sĩ (Nuôi trồng thủy sản và Nuôi trồng thủy sản giảng dạy bằng tiếng Anh – Chương trình quốc tế) với tổng cộng trên 100 học viên và nghiên cứu sinh trong nước và quốc tế. Đến nay, Trường đã đào tạo trên 5000 cựu sinh viên, hiện đang giữ vai trò động lực trong phát triển thủy sản của ĐBSCL và cả nước.

Nghiên cứu khoa học là hoạt động rất năng động của Trường. Trong hơn 10 năm qua, Khoa có trên 200 đề tài các cấp và dự án hợp tác quốc tế. Đặc biệt trong 5 năm gần đây, Trường đã thực hiện 8 chương trình nghiên cứu thuộc Dự Án ODA bao gồm hầu hết các lĩnh vực liên quan đến nuôi trồng thủy sản và quản lý nguồn lợi thủy sản. Các nghiên cứu ngày càng chuyên sâu, hiện đại, thiết thực, liên kết với nhiều ngành và lĩnh vực khác, đáp ứng yêu cầu, bối cảnh và xu hướng phát triển hiện nay. Thông qua các đề tài và dự án, nhiều qui trình công nghệ đã được phát triển và ứng dụng, triển khai hiệu quả vào sản xuất, đặc biệt là sản xuất giống và nuôi các đối tượng thủy sản quan trọng như cá tra, tôm biển, tôm càng xanh, cá đồng…. Hàng năm,Trường tập huấn cho 500-1000 nông dân, cán bộ, công ty trong và ngoài nước về các lĩnh vực khác nhau.

Trường hiện có mạng lưới hợp tác mạnh mẽ với VIFINET, cơ quan các tỉnh ĐBSCL, trên 100 công ty – doanh nghiệp, và trên 50 Viện – Trường, mạng lưới nổi tiến trên thế giới, làm động lực cho liên kết, hợp tác, phát triển ngành thủy sản của Khoa – Trường và trong khu vực.

Với những nổ lực không ngừng và những thành tưu to lớn trong hơn 40 năm qua,Trường Thủy Sản đã và đang góp phần quan trọng trong phát triển nguồn nhân lực chất lượng cao, khoa học công nghệ và kinh tế xã hội trong vùng ĐBSCL và khu vực. Ngành Nông – Lâm bao gồm Thủy Sản của Trường Đại học Cần Thơ được QS University Ranking 2020 xếp Hạng I ở Việt Nam và 250-300 toàn cầu.